В этой статье мы рассмотрим лучшее бесплатное программное обеспечение для молекулярного моделирования^{(Molecular Modeling software)} для ПК с Windows 10 . Используя эти бесплатные программы, вы можете создавать модели различных химических соединений, от простых до сложных. Эта коллекция программного обеспечения полезна для студентов, изучающих биоинформатику, химическую инженерию и т. д. Вы можете добавлять различные элементы из периодической таблицы^{(Periodic Table)} , чтобы образовать химическое соединение. Кроме того, в этом программном обеспечении вы также можете просматривать химическое соединение в разных стилях, таких как каркас, шар и палка, трубы, шар и цилиндр^{(wireframe, ball and stick, pipes, ball and cylinder)} и многое другое.

Программное обеспечение для молекулярного моделирования^(Modeling) для Windows 10

Некоторые из этих программ также включают различные химические группы и структуры для вашего удобства. Просто^(Simply) выберите их, и ваша химическая модель готова. Примеры химических групп включают  спирты, бензол, альдегиды, аминокислоты^{(alcohols, benzene, aldehydes, amino acids)} и т. д . Кроме того, вы также можете выполнять химические расчеты, такие как  энергия, длина связи^{(energy, bond length)} и т. д.

1. Авогадро
2. МолюКАД
3. АргусЛаб
4. Аскалаф Дизайнер

Давайте посмотрим на них.

1] Авогадро

 Avogadro  — отличное бесплатное ПО для молекулярного моделирования с множеством функций. Удобный интерфейс делает его понятным для пользователей. При запуске программы вы увидите черный экран и панель с левой стороны. Вы можете получить доступ к некоторым часто используемым элементам из раскрывающегося меню^{(drop-down menu)} на левой панели. Если вы хотите получить доступ ко всем элементам, просто нажмите « Другое^(other) » в раскрывающемся меню, и программа запустит периодическую таблицу^{(Periodic Table)} . Элемент, который вы выберете из периодической таблицы^{(Periodic Table)} , будет доступен в раскрывающемся списке.

Шаги, чтобы нарисовать химическое соединение:

1. Выберите^(Select) элемент из выпадающего меню на левой панели и нажмите на черный экран, чтобы добавить его.
2. Теперь выберите другой элемент из выпадающего меню.
3. Нажмите и удерживайте левую кнопку мыши и перетащите ее к первому элементу, чтобы соединить его химической связью. Вы также можете выбрать тип химической связи: одинарную, двойную или тройную.

На панели инструментов программы есть разные кнопки:

• Инструмент рисования^{(Draw tool)} : позволяет рисовать различные молекулярные соединения.
• Инструмент навигации^{(Navigation tool)} : с его помощью вы можете перемещать, вращать, увеличивать и уменьшать масштаб молекулярной модели.
• Инструмент манипулирования, ориентированный^{(Bond centric manipulation tool)} на связь: выберите этот инструмент и щелкните любую связь, чтобы просмотреть угол.
• Инструмент автоматического поворота^{(Auto rotation tool)} : выберите этот инструмент и нажмите кнопку « Пуск^(Start) ». Теперь нажмите и удерживайте левую кнопку мыши и перетащите ее в любом направлении. Отпустите левую кнопку мыши, и молекулярная модель начнет вращаться автоматически.

Если вы хотите автоматически изменять длину связи соединений, перейдите в « Extensions > Optimize Geometry » или нажмите « Ctrl+Alt+O ». Чтобы рассчитать энергию, перейдите в « Extensions > Molecular Mechanics > Calculate Energy ».

Сохранение файла^{(Saving the File)} : вы можете сохранить свой проект в нескольких форматах, включая  PDB, ENT, CHM, ALC, CDXML, CDX, C3D2, C3D1, SD, SDF, DMOL, CHT, GAM . Помимо этого, также доступна опция экспорта, с помощью которой вы можете сохранить свой проект в  формате PDF, SVG, BMP, JPG, PNG^{(PDF, SVG, BMP, JPG, PNG)} и т. д.

2] Молукад

MoluCAD  — еще одно бесплатное бесплатное ПО для молекулярного моделирования в этом списке. Как и Avogado^(Avogadro) , он также имеет множество функций. В этом программном обеспечении вы можете одновременно просматривать как 2D-, так и 3D-изображения. Некоторые часто используемые элементы доступны на левой панели программного обеспечения. Чтобы добавить его в основное пространство, просто нажмите на любой из элементов. Если элемент, который вы хотите добавить, недоступен там, вы можете выбрать его из Периодической таблицы^{(Periodic Table)} . Чтобы просмотреть периодическую таблицу^{(Periodic Table)} , щелкните правой кнопкой мыши по черному пространству и нажмите кнопку « Добавить атом^{(Add Atom)} ».

Шаги, чтобы нарисовать химическое соединение:

1. Нажмите^(Click) на любой из элементов на левой панели, чтобы добавить его.
2. Нажмите^(Click) на другой элемент, чтобы добавить его, или вы можете выбрать его из периодической таблицы^{(Periodic Table)} .
3. Чтобы соединить элементы, перейдите в « Add > Bonds – Connect Atoms » и выберите тип химической связи. Теперь нажмите на первый атом, а затем нажмите на второй.

Помимо элементов, вы также можете добавлять соединения. На правой панели вы найдете различные  молекулы, аминокислоты, функциональные группы, неподеленные пары атомов^{(molecules, amino acids, functional groups, lone pair atoms)} и т. д. Выберите любую структуру и перетащите ее в основное пространство. Вы можете рассчитать энергию молекул, нажав « Energy > Evaluate Energy ».

Используя меню « Запрос^(Query) », вы можете рассчитать  расстояние между двумя атомами, длину связи, угол связи, угол кручения, центр масс^{(distance between two atoms, bond length, bond angle, torsion angle, the centre of mass)} и т. д . Вы можете просматривать трехмерную структуру в четырех различных видах:  сверху, спереди, сбоку и косой^{(top, front, side, and oblique)} . Перейдите в « View > Graphics Mode », чтобы просмотреть модель в различных формах, таких как  мяч и клюшка, заполнение пространства, трубы^{(ball & stick, space fill, pipes)} и т. д.

Сохранение файла^{(Saving the file)} : Вы можете сохранить проект в формате MCD . Если вы используете опцию « Экспорт » в меню « ^(Export)Файл^(File) », вы можете сохранить свой проект в  форматах JPEG^(JPEG)  и  Windows BITMAP  .

3] АргусЛаб

ArgusLab  — еще одно удобное программное обеспечение для молекулярного моделирования с простыми для понимания функциями. Используя это программное обеспечение, вы можете создавать структуры различных химических соединений. На левой панели программы доступны три вкладки:

• Атомы^(Atoms) : Эта вкладка содержит различные элементы периодической таблицы^{(Periodic Table)} . При щелчке по каждому атому программа отображает его геометрию. Нажмите^(Click) на кнопку « Периодическая таблица^{(Periodic Table)} », чтобы запустить периодическую таблицу^{(Periodic Table)} .
• Кольца^(Rings) : Здесь вы получите различные типы химических кольцевых структур.
• Аминокислоты^{(Amino Acids)} : на этой вкладке показаны различные типы аминокислот. В этой вкладке также доступен « Конструктор полипептидов ».^{(Polypeptide Builder)}

Шаги, чтобы нарисовать химическое соединение:

1. Нажмите на вкладку « Atom » на левой панели, чтобы добавить элемент.
2. Выберите^(Select) любой из доступных элементов. Если нужного вам элемента нет, вы можете выбрать такой же из « Таблицы Менделеева^{(Periodic Table)} ».
3. Щелкните^(Use) правой кнопкой мыши, чтобы поместить элемент в отведенное место.
4. Выберите^(Select) другой элемент. Теперь выберите последний элемент, щелкнув левой кнопкой мыши, и поместите другой элемент, щелкнув правой кнопкой мыши. Это соединит два элемента и сформирует соединение.
5. Чтобы добавить кольца и аминокислоты в пространство, выполните те же действия.

4] Аскалаф Дизайнер

Ascalaph Designer  — еще одно хорошее бесплатное ПО для молекулярного моделирования. Лучшая часть программного обеспечения заключается в том, что вам не нужно устанавливать его на свой компьютер. Он поставляется с исполняемым файлом. Программное обеспечение будет загружено в формате zip. После распаковки вы найдете исполняемый файл в папке « bin ».

Шаги, чтобы нарисовать химическое соединение:

1. Нажмите « Ctrl+N », чтобы начать новый проект.
2. Чтобы добавить элементы, вам нужно открыть периодическую таблицу^{(Periodic Table)} . Для этого перейдите в « Build > Free Drawing ».
3. Выберите^(Select) любой из элементов и поместите их в пространство, нажав клавиши « Ctrl+Shift ».
4. Поместите другой элемент, используя описанный выше шаг, и перетащите его к последнему элементу, чтобы соединить их химической связью.

Вы можете просматривать каждое соединение в различных формах, таких как  шар и стержень, каркас, CPK^{(ball and stick, wireframe, CPK)} и т. д ., нажимая кнопки на правой панели. Когда вы выбираете любой элемент из Периодической таблицы^{(Periodic Table)} , она показывает вам дополнительную информацию, такую ​​как  имя элемента, гибридизация, ковалентность и силы притяжения Ван-дер-Ваальса^{(element name, hybridization, covalent, and Van Der Waals forces of attraction)} . Нажмите на меню « Анализ^(Analyze) », чтобы выполнить различные расчеты, включая  энергию, температуру, давление, дипольный момент^{(energy, temperature, pressure, dipole moment)} и т. д.

Сохранение файла^{(Saving the file)} : Вы можете сохранить свой проект только в его собственных форматах, включая  mim, hin, xmol ,  mmol, ^{(mmol, smol, )} smol и т. д. Это недостаток этой бесплатной программы.

Мы надеемся, что вы нашли этот пост полезным для своих проектов в школе и колледже.

Best free Molecular Modeling software for Windows 10

In this article, we will cover the bеst free Molecular Modeling software for Windows 10 PC. Using these freeware, you can create models of various simple to complex chemical compounds. This software collection is helpful for the students of bioinformatics, chemical engineering, etc. You can add different elements from the Periodic Table to form a chemical compound. Moreover, in these software, you can also view a chemical compound in different styles, like wireframe, ball and stick, pipes, ball and cylinder, and more.

Molecular Modeling software for Windows 10

Some of these software also include different chemical groups and structures for your convenience. Simply select them, and your chemical model is ready. Examples of chemical groups include alcohols, benzene, aldehydes, amino acids, etc. Apart from that, you can also do chemical calculations like energy, bond length, etc.

1. Avogadro
2. MoluCAD
3. ArgusLab
4. Ascalaph Designer

Let us take a look at them.

1] Avogadro

 Avogadro is an excellent molecular modeling freeware that comes with plenty of features. Its user-friendly interface makes it easy to understand for the users. On launching the software, you will see a black screen and a panel on the left side. You can access some commonly used elements from the “drop-down menu” on the left panel. If you want to access all the elements, simply click on “other” in the drop-down menu, and the software will launch the Periodic Table. The element which you select from the Periodic Table will be available in the drop-down list.

Steps to draw a chemical compound:

1. Select an element from the drop-down menu on the left panel and click on the black screen to add it.
2. Now, select another element from the drop-down menu.
3. Press and hold the left click of the mouse and drag it to the first element to connect it with a chemical bond. You can also select the type of chemical bond, single, double, or triple.

There are different buttons on the toolbar of the software:

• Draw tool: It lets you draw different molecular compounds.
• Navigation tool: Using it, you can move, rotate, zoom in and zoom out the molecular model.
• Bond centric manipulation tool: Select this tool and click on any of the bonds to view the angle.
• Auto rotation tool: Select this tool and click on the “Start” button. Now, press and hold the left click of the mouse and drag it in any direction. Release the left click, and the molecular model will start rotating automatically.

If you want to resize the bond length of compounds automatically, go to “Extensions > Optimize Geometry” or press “Ctrl+Alt+O.” To calculate the energy, go to “Extensions > Molecular Mechanics > Calculate Energy.”

Saving the File: You can save your project in multiple formats, including PDB, ENT, CHM, ALC, CDXML, CDX, C3D2, C3D1, SD, SDF, DMOL, CHT, GAM. Apart from this, an export option is also available, using which you can save your project in PDF, SVG, BMP, JPG, PNG, etc.

2] MoluCAD

MoluCAD is another free molecular modeling freeware in this list. Like Avogadro, it also comes with a lot of features. In this software, you can view both 2D and 3D views adjacently. Some commonly used elements are available on the left panel of the software. To add it to the main space, simply click on any of the elements. If the element you want to add is not available there, you can select it from the Periodic Table. To view the Periodic Table, right-click on the black space and click on the “Add Atom” button.

Steps to draw a chemical compound:

1. Click on any of the elements on the left panel to add it.
2. Click on another element to add it, or you can select it from the Periodic Table.
3. To connect the elements, go to “Add > Bonds – Connect Atoms” and select the type of chemical bond. Now click on the first atom and then click on the second one.

Apart from elements, you can also add compounds. On the right panel, you will find different molecules, amino acids, functional groups, lone pair atoms, etc. Select any structure and drag and drop it to the main space. You can calculate the energy of the molecules by clicking on “Energy > Evaluate Energy.”

Using the “Query” menu, you can calculate the distance between two atoms, bond length, bond angle, torsion angle, the centre of mass, etc. You can view the 3D structure in four different views, top, front, side, and oblique. Go to “View > Graphics Mode” to view the model in different forms, like ball & stick, space fill, pipes, and more.

Saving the file: You can save the project in MCD format. If you use the “Export” option in the “File” menu, you can save your project in JPEG and Windows BITMAP formats.

3] ArgusLab

ArgusLab is another user-friendly molecular modeling software that comes with easy to understand features. Using this software, you can create the structure of different chemical compounds. On the left panel of the software, three tabs are available:

• Atoms: This tab contains different elements of the Periodic Table. On clicking each atom, the software displays its geometry. Click on the “Periodic Table” button to launch the Periodic Table.
• Rings: Here, you will get different types of chemical ring structures.
• Amino Acids: This tab shows different types of amino acids. In this tab, “Polypeptide Builder” is also available.

Steps to draw chemical compound:

1. Click on the “Atom” tab on the left panel to add an element.
2. Select any of the available elements. If your desired element is not there, you can select the same from the “Periodic Table.”
3. Use right-click to place the element on the space provided.
4. Select another element. Now, select the last element using the left-click and place the other element by using the right-click. This will join the two elements and form a compound.
5. To add rings and amino acids in the space, follow the same steps.

4] Ascalaph Designer

Ascalaph Designer is one more good molecular modeling freeware. The best part of the software is that you need not install it on your PC. It comes with an executable file. The software will be downloaded in zip format. After extracting it, you will find the executable file in the “bin” folder.

Steps to draw a chemical compound:

1. Press “Ctrl+N” to start a new project.
2. To add elements, you have to open the Periodic Table. For this, go to “Build > Free Drawing.”
3. Select any of the elements and place them in the space by pressing the “Ctrl+Shift” keys.
4. Place another element using the above step and drag it to the last element to connect them with a chemical bond.

You can view every compound in different forms like ball and stick, wireframe, CPK, etc., by clicking on the buttons on the right panel. When you select any element from the Periodic Table, it shows you additional information like element name, hybridization, covalent, and Van Der Waals forces of attraction. Click on the “Analyze” menu to perform different calculations, including energy, temperature, pressure, dipole moment, etc.

Saving the file: You can save your project only in its own formats, including mim, hin, xmol, mmol, smol, etc. This is the demerit of this freeware.

We hope you found this post useful for your school and college projects.

Related posts

• Best бесплатно Barcode Scanner software для Windows 10

• Best Free Circuit Simulation software для Windows 10

• Best Free Remote Desktop Software для Windows 10

• Best бесплатный Drone Mapping software для Windows 10

• Best IP Camera apps для Windows 10 PC and Android Phone

• Best бесплатное программное обеспечение Connectify alternative для поделиться Internet в Windows 10

• Best бесплатно Window Manager software для Windows 10

• Best Free PCB Design Software для Windows 10

• Win Update Stop: отключить Windows Updates на Windows 10

• Long Path Fixer tool будет исправлять длинные ошибки Path Too в Windows 10

• Best Free ISO Burners для Windows 10

• Windows Search Alternative Tools для Windows 10

• Best Speech Recognition software для Windows 10

• Zoom Investment Portfolio Manager для Windows 10

• Reduce Отвлечения в Windows 10; Blackout Части computer screen!

• Best TV Tuner software для ПК Windows 10

• Best Бесплатное программное обеспечение для рисования на экране в ПК Windows 10

• ClickChart - бесплатный Diagram & Flowchart software для Windows 10

• Best Free Hospital Management software для Windows 10

• Geek Uninstaller - портативный All-In-One Uninstaller для Windows 10